איכות המזוזה תלויה בטיב הקלף, באישיותו של הסופר שכתב אותה וביפי הכתב. מזוזות קטנות הן בדרך כלל בעלות איכות ירודה לעומת מזוזות גדולות, שבכתיבתן אפשר לדייק בכל פרטי ההלכות הכרוכות בכתיבתן (גם מזוזה קטנה יכולה להיות ברמה גבוהה מאוד, אולם אז מחירה יהיה גבוה משל מזוזה גדולה, שכן רמות המאמץ והדיוק הנדרשים לצורך כתיבתה גבוהות יותר).

הקלף קלף המזוזה צריך להיות עשוי מעור של בהמה כשרה, ועיבודו חייב להיעשות מתוך כוונה מיוחדת, "לשם מצוות מזוזה".

יש יצרנים המושחים את יריעות הקלף בסיד, וזאת כדי להקל על הכתיבה. כתיבה על קלף כזה קלה יותר, אולם הסיד הופך את המזוזה לפגיעה יותר ללחות ולשִנֵי הזמן. הסיד עלול להיסדק ולגרום למחיקת אותיות. לכן כדאי להימנע מקניית מזוזות כאלה. גם באיכות הקלף יש כמה וכמה רמות.

חשוב לדעת: מזוזה המודפסת על נייר, גם אם הנייר דמוי קלף — אין לה כל ערך. אין זו מזוזה כלל, ודיירי הבית אינם מקיימים את המצווה. למרבה הצער יש המפיצים זיופים מסוג זה, וגם זו סיבה לקנות מזוזות רק במקום אמין.

הדרך הפשוטה להשיג מזוזות כשרות ומהודרות היא לקנות אותן אצל סופר ירא שמים, מוּכר ואמין, או בחנות המנוהלת בידי אנשים הידועים כיראי שמים.

הסופר המזוזה נכתבת על־ידי 'סופר סת"ם' (מי שכותב ספרי תורה, תפילין, מזוזות) שלמד את אומנות הכתיבה המיוחדת הזו ואת דיניה, והוכשר לשמש במלאכה זו.

הסופר צריך להיות איש אמין וירא שמים, מכיוון שקיומן של הלכות רבות בכתיבת המזוזה תלוי ביושרו, ואיש מלבדו לא יוכל לדעת אם אכן הקפיד עליהן.

קולמוס ודיו את המזוזה כותבים בעזרת נוצה שעובדה לקולמוס, בדיו שחור מיוחד, שתהליך עשייתו כרוך אף הוא בשורה של הלכות שיש להקפיד עליהן.

נרתיק המזוזה את המזוזה גוללים (כדאי שהדבר ייעשה על־ידי מומחה) מהסוף להתחלה, והכְּתב כלפי פנים. לאחר מכן עוטפים אותה, בדרך כלל בניילון, כדי לשמור עליה מפגעי מזג האוויר, ומכניסים אותה לנרתיק, שתפקידו להגן עליה. אין לנרתיק משמעות הלכתית, ולכן אין כללים על החומר שממנו הוא עשוי וצורתו. עם זה, מזוזה הקבועה בתוך חדר שינה של ההורים (כלומר, שהיא בתוך החדר, מעברה הפנימי של הדלת) — וכן בכל חדר שבו ישן זוג נשוי — על נרתיק המזוזה להיות אטום ולא שקוף.

שתי הערות חשובות: א) נרתיק המזוזה הוא דבר חיצוני בלבד, ולכל היותר יש בו משום 'נוי מצווה', אבל אין הוא העיקר. את עיקר הכסף ראוי להשקיע בהידורה של המזוזה עצמה. ב) יש הטועים ומניחים את הקלף המגולגל כשהוא מופנה כלפי מטה, ולמעשה המזוזה הפוכה. המזוזה חייבת להיקבע כשהכתב כלפי מעלה, ואילו מזוזה הפוכה פסולה וכאילו אין היא קיימת. אם נקבעה מזוזה כשהיא הפוכה, יש לקבוע אותה במצב נכון.